Учился также в США по стипендии «Фонда Форда». На протяжении всей творческой жизни был связан с педагогикой: преподавал в Национальном университете, а также в университетах Антиохии, Кауки и Букараманги. Начиная с 1988 года работал с Национальным молодежным оркестром в Каракасе, созданном в рамках Системы молодежных оркестров, призванных «победить порочный круг бедности» венесуэльской молодежи. По возвращении в 1995 году в Боготу, преподавал композицию в консерватории музыки «Колумбийского национального университета». В 2002 году по приглашению видного венесуэльского композитора и музыкального деятеля Хосе Антонио Абреу Атеортуа создает и возглавляет Латиноамериканскую кафедру композиции в Каракасе, наряду с этим продолжая дирижерскую деятельность с молодежными оркестрами Венесуэлы. За свою деятельность удостоен многих почетных наград и званий.

Атеортуа, без сомнения, наиболее признанный в международных кругах колумбийский музыкант. В широком спектре стилистических связей и пред-почтений композитора можно выделить преимущественную опору на неоклассические традиции, умеренное употребление авангардистских видов композиторской техники и глубокую приверженность к американской тематике. Наряду с обобщенными способами отображения латиноамериканского мироощущения, в музыке Атеортуа встречаются и множественные примеры цитирования и воссоздания типичных национальных жанров и манер исполнения, таких, как антифонное пение, использование и имитирование звучания автохтонных ударных и духовых инструментов.